陸奥圓明流外伝修羅の刻第一部宮本武蔵編时值江户时代初期，在德川幕府刚刚完成统一的日本国内，是一个乱世中还拥有着理想的人们比拼自己本领，赌上自己生命战斗的时代在这些人中，有着最高呼声的巨人“宫本武藏”遇上了“修罗”。这是一场以最强者为目标的，男人之间宿命的对决。

草薙素子之后，巴特与侦探出身的陀古萨结为搭档。近期发生多起机器人偶杀害主人继而自杀的事件，由于受害者家属均无公诉，且死者中有政客与公安官员，于是公安9课派出巴特小组调查此案。杀人人偶皆为荒凉地带公司出品的哈德莉机型，应部分顾客要求，该机型同时具备异性玩伴的功能，巴特从荒凉地带公司出货官遇害入手，卷入